Mise NATO ISAF funguje pod mandátem OSN. Jejím úkolem je asistovat afghánské vládě při zajišťování bezpečnosti v zemi. Alianční jednotky doposud operovaly v Kábulu a ve 13 provinciích severního a západního Afghánistánu. Jednotky ISAF jsou složeny ze zástupců členských i nečlenských zemí aliance, čímž je zajištěna širší mezinárodní podpora misi. Celkem je do ní zapojeno 37 zemí.
Jižní Afghánistán se skládá ze šesti provincií: Day Kundi, Helmand, Kandahar, Nimroz, Uruzgan a Zabul. V této oblasti budou působit zhruba osm tisíc australských, britských, kanadských, estonských, dánských, holandských, rumunských a amerických vojáků. Proces přebírání kontroly a velení nad tímto prostorem trval několik měsíců.
Jednotky vedené USA si ponechaly kontrolu nad východním Afghánistánem, kde je jejich nejdůležitějším úkolem bojovat proti Talibanu a dalším podobným organizacím.